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科學家重建700年前古代病毒:仍具感染能力

時間:2014-10-30 10:12:32 來源:新浪科技 評論:0 點擊:0
這塊冰芯中保留了古老的馴鹿糞便。幾千年來,馴鹿常常聚集在冰雪覆蓋的地區,以躲避夏天的酷熱和昆蟲的襲擾。在這些糞便中,可以找到馴鹿的DNA、消化的植物,以及病毒,研究者由此可以檢測出古代病毒的基因組。  這塊冰芯中保留了古老的馴鹿糞便。幾千年來,馴鹿常常聚集在冰雪覆蓋的地區,以躲避夏天的酷熱和昆蟲的襲擾。在這些糞便中,可以找到馴鹿的DNA、消化的植物,以及病毒,研究者由此可以檢測出古代病毒的基因組。
在發現了古代馴鹿糞便中的DNA病毒和RNA病毒之后,研究人員重組了DNA病毒的基因組,以檢測其是否具有感染植物的能力。煙草本賽姆氏(Nicotiana benthamiana)品種在接種了古代DNA病毒之后,出現了感染的特征,分別位于接種的葉子(橙色箭頭)和新長出的葉子(白色箭頭)上。  在發現了古代馴鹿糞便中的DNA病毒和RNA病毒之后,研究人員重組了DNA病毒的基因組,以檢測其是否具有感染植物的能力。煙草本賽姆氏(Nicotiana benthamiana)品種在接種了古代DNA病毒之后,出現了感染的特征,分別位于接種的葉子(橙色箭頭)和新長出的葉子(白色箭頭)上。
加拿大西北地區塞爾維恩山脈的亞北極冰區。這些冰層不僅是獨一無二的考古寶藏所在,而且還保留著數千年來不斷積累起來的生物樣品。  加拿大西北地區塞爾維恩山脈的亞北極冰區。這些冰層不僅是獨一無二的考古寶藏所在,而且還保留著數千年來不斷積累起來的生物樣品。

  北京時間30日消息,據國外媒體報道,近日,來自舊金山血液系統研究所的埃里克·德爾沃特(Eric Delwart)及其同事研究發現,在采自亞北極冰區的冰凍馴鹿糞便中,發現了兩組700年前的病毒基因組序列,包括一部分病毒RNA基因組,和一個DNA病毒的基因組。其中DNA病毒表現出了感染植物的能力。他們的研究結果發表在《美國科學院院刊》(PNAS)上。

  科學家對于病毒的演化過程了解并不多。認識這些古代病毒的結構將有助于對病毒演化的探索。然而,科學家只對數量很少的古代病毒進行了基因組測序。病毒的變異很快,很難確定新的序列與其他病毒之間是否存在聯系,因此很難對古代病毒進行重建。除此之外,古代病毒的核酸物質往往會迅速分解,給測序帶來了困難。

  為了找到保存完好的古代病毒,德爾沃特和他的團隊來到了加拿大塞爾維恩山脈(Selwyn Mountains)一片已有4000年歷史的冰區,對其中的馴鹿糞便進行了分析。在檢查一個700年前的冰芯時,他們從冰凍的糞粒中鑒定出了兩組保存完好的病毒序列。

  其中一組是一個RNA病毒的部分基因組,研究者認為它可能來自能夠感染昆蟲的蟋蟀麻痹病毒屬(Cripavirus)。馴鹿可能在進食的時候吃進了感染這種病毒的昆蟲。被馴鹿或者馴鹿糞便吸引而來的昆蟲也可能是病毒的來源。

  根據另一組病毒基因序列,研究團隊成功地重建了一種DNA病毒的完整基因組。這種病毒與現生所有已被測序的病毒都有不同。不過,科學家還是發現它與一類感染植物的雙生病毒(geminiviruses),以及一類發現于蜻蜓、真菌和動物糞便中的病毒(gemycircularviruses)存在較遠的聯系。

  為了了解DNA病毒的更多特性,研究人員采用了煙草本賽姆氏(Nicotiana benthamiana)品種作為實驗材料。這一煙草品種常常作為研究克隆雙生病毒感染力的模型。實驗結果發現,在接種病毒的葉子,以及剛長出來的新葉上,都出現了感染的特征。不過,受到感染的植株并未出現任何患病癥狀。研究者稱,這可能是因為煙草本賽姆氏并不是這種病毒的理想宿主。

  研究團隊認為,馴鹿應該是在進食的時候吃進了這種DNA病毒。較早之前的研究顯示,病毒在經過動物消化道之后還可能保持著感染能力。隨著氣候變化問題的加劇,極地冰川的融解速度加快,更多的病毒顆粒(可能還保持著感染力)將可能被釋放到外界環境中。

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